Cortana (SN: CTN 0452-9) é uma IA esperta criada com fins de ser utilizada na operação RED FLAG, nas etapas 3 e 4 da operação que envolviam sequestro de uma nave e infiltração até a capital Covenant e lá invadindo o sistema para tomar os Prophets como reféns para uma posterior negociação, o que não veio a ocorrer de fato.
Foi criada em Reach a partir do cérebro de flash clones da Dra Catherine Halsey (no qual 20 foram criados, apenas dois sobrevivendo, sendo um dos dois restantes usados para criar Cortana). O método era escanear os caminhos neurais do cérebro copiado em um processo chamado Modelagem de Impressão Cognitiva. Convencionalmente o padrão era o de escanear os caminhos neurais do indivíduo em questão, o que após isso seria a destruição do cérebro modelo, e a IA já criada e posta em um chip, o que em resumo significava que a pessoa morreria após todo escaneamento, porém não foi o caso graças a trapaças de Halsey em segredo, usando clones dela mesma. Suas primeiras palavras foram “Quando o jogo termina, o rei e o peão vão para a mesma caixa”, um ditado italiano. Assim ela era uma das últimas duas IA’s criadas a partir do cérebro da Dra Halsey, a outra sendo sua predecessora chamada de Kalmiya, que tinha similaridades com IA’s espertas.
Ela foi dada a John 117 Master Chief, sendo que, na realidade ela analisando os perfis de serviço de Spartans, veio a selecionar John 117, baseando se na capacidade de liderança natural, bravura, e outros aspectos, sendo sua sorte o diferencial que outros não tinham. Sendo assim começou o trabalho em conjunto com Chief, em um teste criado pelo Coronel James Ackerson, chamado pela Dra Halsey como sabotagem, algo realmente pesado, que incluiu, ODST’s armados, minas anti-tanque, torres automáticas em ambiente perigoso, e ataques aéreos por Unidades Skyhawk.
Após o teste, ela foi introduzida na Pillar of Autumn para executar a analise da nave e supervisionar o reequipamento da Pillar, sendo assim depois prevista sua substituição por outra IA que seria verdadeiramente dedicada a nave, porém devido as circunstâncias, foi forçada a assumir o posto definitivamente. E enquanto a bordo não deixou de responder com uma pequena vingança contra o Coronel Ackerson, simplesmente invadindo seu sistema e fazendo chantagem, esperando que de alguma forma isso o mandasse de volta para a linha de frente de combate. A partir dai que ela desenvolveu sua profunda lealdade para com John 117, o que só viria a aumentar mais a cada dia.
Participou de muitas missões importantes junto a Master Chief, como na Instalação 04 onde junto a seu companheiro impediu o disparo do Halo, tomando o index e iniciando a sobrecarga dos motores da Pillar, logo após fugindo não antes de Chief terminar o serviço detonando os motores. Também ajudando na navegação na Longsword, para o resgate de Linda, Johnson e outros sobreviventes da destruição do Halo que conseguiram escapar em Pelicans.
Após tudo isso, acabou por entrar em contato com o Domínio, na instalação Forerunner Gênesis (um planeta escudo), sendo aparentemente “curada da rampancy” no ato, onde foi acolhida por Warden Eternal e foi, acreditando que o manto da responsabilidade pertencia as criações, despertando os Guardians, causando grandes estragos em diversas colônias Humanas. Em meio a este caos, Chief e o Blue Team foram em busca dela para tentar impedi-la, o que levou o Fire Team Osiris a ir atrás de Chief achando que ele pudesse ser o responsável por sua ausência sem permissão.